Le médecin introduit un doigt via l'anus pour palper la prostate. Il peut ainsi évaluer le volume prostatique et éventuellement détecter la présence d'une masse anormale (tumeur). Une prostate douloureuse au toucher rectal peut indiquer la présence d'une inflammation prostatique.
Le toucher rectal permet également de déceler certaines anomalies (tumeur, hémorroïdes) dans la partie terminale du rectum.
L'examen est inconfortable mais non douloureux.